Вышел дайджест «Академгородок. Лучшее за июль»

10 окт 2014 - 05:54

Вышел дайджест «Академгородок. Лучшее за июль» Как известно, лето - пора отпусков, отдыха, в том числе и от Интернета. Поэтому вы могли пропустить ряд интересных материалов, появившихся на нашем портале в июле. Чтобы восполнить этот пробел, мы подготовили подборку эксклюзивных материалов июля. Теперь Вы можете скачать ее отдельным файлом.

Читайте в дайджесте:

– «Время учеников» – по итогам пресс-тура в Институте теплофизики СО РАН в канун 100-летия выдающегося физика – академика Самсона Семеновича Кутателадзе

– «Полвека на гребне информационной волны» – Институт вычислительной математики и математической геофизики (ИВМиМГ) СО РАН празднует свой полувековой юбилей

– «Съедобные вакцины» – в Институте цитологии и генетики СО РАН создали трансгенную морковь, обладающую лечебными свойствами

– «Решето для кислорода» – В Институте химии твердого тела и механохимии СО РАН изобрели специальную мембрану, способную «фильтровать» воздух… на молекулярном уровне

– «Несбывшаяся мечта» – Почему наработки ученых Академгородка в области индивидуального домостроения остаются практически неуслышанными в самом Академгородке?

– «Главная мотивация» – Интервью с директором Института терапии СО РАМН Михаилом Ивановичем Воеводой

– «ГМО: угроза или решение?» – Интенсивное земледелие без поддержки генной инженерии угрожает обострением экологических проблем, считают специалисты Института цитологии и генетики СО РАН

Волоконно-оптический суверенитет

Два года назад несколько стран мира подняли вопрос о том, чтобы лишить США монополии по распределению мирового интернет-трафика. Большинство магистральных каналов – подводных ВОЛС – было проложено Штатами, за их деньги и через их территории. Однако страны, ведущие независимую внешнюю политику и обладающие достаточными технологическими и финансовыми ресурсами – Китай, Индия, Бразилия и Россия - ведут работу по строительству собственной магистральной сетевой инфраструктуры. Если в 2008 году через американские дата-центры прошло более 96% латиноамериканского трафика, около 92% российского и СНГ, более 61% азиатского и порядка 34% европейского, то в 2012 эти цифры значительно сократились – около 80%, 70%, 40% и 20% соответственно. В России диверсификация системы международных трафик-маршрутов происходит постепенно, с ежегодным темпом в 4-7%. В Китае же сетевая ВОЛС-независимость и вовсе возведена в ранг важнейшей государственной программы в контексте Стратегии национальной безопасности. Эксперты считают, что последние угрозы Запада отключить РФ доступ к глобальной сети интернет только ускорят этот процесс и ВОЛС-суверенитет от США наша страна достигнет не к 2030, как планировалось, а уже к 2020 году. Впрочем, возможности Запада «отрубить сеть» России и сейчас можно назвать весьма гипотетическими.

 

США теряют контроль

Одним из первых выступило против отслеживания американскими спецслужбами трафика правительство Бразилии. В частности, президент Бразилии Дилма Русефф отменила официальный визит в США (после того, как СМИ узнали о перехвате американскими спецслужбами переписки между Бразилией и Мексикой) и заявила о создании подводной волоконно-оптической сети, которая соединит страну с Европой, Азией и Африкой в обход США. На данный момент страна работает над созданием собственных крупных дата-центров, и рассчитывает заставить местных интернет-провайдеров использовать только их. На Кубе правительство пошло дальше. Между островом и материком (Южной Америкой) была проложена подводная ВОЛС, получившая название ALBA-1 и соединившая Кубу у с Ямайкой и Венесуэлой. Она была запущена в тестовом режиме в январе этого года.

Телекоммуникационные провайдеры в Азии сейчас одновременно ведут несколько грандиозных проектов по созданию магистральных кабельных систем как в Тихом, так и в Индийском океанах. Стоимость каждого такого проекта составляет от 300 миллионов до 2,5 миллиардов долларов. В результате, к 2018 году в мире появится еще 46 тысяч километров волоконно-оптических линий связи, неподконтрольных США, а Китай получит полную независимость от американской сетевой инфраструктуры.

А что в России? Работа идет, но не афишируется. Например, прошла совершенно незамеченной в СМИ информация о том, в 2012 году ОАО «Ростелеком» купило 100% акций компании RETN Capital Ltd, зарегистрированной в Великобритании. После этого приобретения «Ростелеком» получил прямой доступ к работе на зарубежном рынке магистральных сетей связи, потому что сеть RETN располагает на сегодня панъевропейским кольцом линий связи протяженностью более 20 тыс. км и несколькими десятками собственных узлов связи в СНГ, Восточной и Западной Европе и США.

Также мало кто знает, что эта британская сеть была создана двумя петербургскими компаниями связи «ПетерСтар» и «Элтел» в 2002 году. Затем «ПетерСтар» вышел из этого бизнеса, и «Элтел» стал развивать его самостоятельно. Сеть RETN практически окольцовывает Земной шар, замыкаясь между Восточным и Западным полушариями путем соединения узлов доступа в Гонконге и Лос-Анжелесе. Пропускная способность линии связи между этими узлами впечатляет ― 2,5 Гбит/с. В Западном полушарии сеть RETN пересекает территорию США с востока на запад, ответвляясь на юго-восток в направлении Майами. В Восточном полушарии крайний западный узел связи находится в Великобритании, самый восточный ― в Японии. Европейский фрагмент, построенный в виде кольца по технологии DWDM, имеет пропускную способность 10 Гбит/с. Однако уровень зависимости от американской глобальной волоконно-оптической инфраструктуры в нашей стране пока сохраняется на довольно высоком уровне и оценивается специалистами в 67%. А если считать ВОЛС, подконтрольные союзникам США, то и все 90%.

 

Война страшилок

Сегодня, на фоне украинского кризиса, тема сетевого суверенитета России от Запада стала актуальной как никогда. И подтверждением этому послужила эмоциональная угроза отключить нашу страну от сети интернет, прозвучавшая от американских, а затем и европейских «партнеров». «Обычный блеф» - почти в один голос заявили эксперты телекомрынка. На аппаратном уровне угроза не исполнима в принципе – магистральных каналов из России выходит 23, и только 7 из них следуют в недружественные страны. На уровне программного обеспечения сеть тоже не отрубить – если ICANN по приказу из Вашингтона удалит маршрутизацию домена .RU, первое время выходить на ресурсы можно по IP, а затем подключить «зеркала», хранящие маршруты. При этом Штатам придется долго и мучительно перестраивать всю доменно-преобразовательную систему, потому что один из тринадцати мировых (корневых) DNS серверов находится в Новосибирске. Зато государство оперативно использовало этот информационный повод для того, чтобы поставить под тотальный контроль всю национальную сетевую инфраструктуру – на случай войны или массовых беспорядков в правительстве будет рубильник, отключающий в стране интернет как таковой.

Теме возможного отключения России от глобальной сети было посвящено специальное экстренное совещание Совета безопасности России с участием президента Путина. Чиновники Минкомсвязи доложили главе государства о результатах июльских учений, целью которых было протестировать устойчивость работы интернета на территории страны и способности предотвратить нарушения в условиях недружественных «целенаправленных действий». В итоге, было решено проработать меры, «укрепляющие суверенитет российского сегмента всемирной сети». В частности, обсуждается введение особого порядка управления интернетом, который предусматривает возможность отключения России от глобальной сети. Стоит вспомнить, что еще в апреле член Совета Федерации Максим Кавджарадзе выступил с инициативой создать внутренний интернет под названием «Чебурашка», изолированный для доступа из стран Евросоюза и США. Теперь же инициативу взяла нижняя палата парламента - депутат Госдумы Илья Костунов предложил закрыть рунет от США и ЕС, а в качестве спасительной меры он на полном серьезе  предложил раздать всем гражданам флешки с восстановительной программой.

Пока общественность обсуждает "сетевой апокалипсис", а чиновники защитные меры,  специалисты констатируют – отключение крупной страны от сети интернет технически невозможно. Почему, мы разбирались с экспертами.

 

Физически «обрубить»

Собственно у тех, кто действительно вознамерится лишить Россию выхода в глобальную сеть, существует два пути – физическое (аппаратное) отключение магистральной сетевой инфраструктуры на входе в страну, иначе говоря – кабель в точке входа в рунет взять и отключить, или, скажем, на худой конец, просто обрезать. Второй путь – поставить блок на уровне программного обеспечения, т.е. удалить зону .RU из корневого маршрутизатора DNS, который контролируется американской корпорацией ICANN. Но физическое отключение было возможно лет 15 назад, когда весь сетевой трафик шел через 4 магистральных канала – 3 в Европу (1 морской и 2 наземных), 1 в США (морской). Сейчас же из России выходят целых 23 канала, причем более половины из них идут совсем не в западном направлении (только в Китай идет 5 линий). Совокупная пропускная способность магистральных маршрутов в точках выхода из РФ почти в 3 раза превышает существующий трафик, т.е. если США и ЕС отключат свои магистрали, то российские интернет-пользователи этого даже не заметят, а Китай будет получать больше прибыли за обслуживание российского транзитного трафика (которую сейчас получают, в основном,  американские компании).  

 

Отключить DNS  

Технически изолирование какого-либо национального сегмента интернета страны извне также возможно через систему так называемых корневых DNS-серверов всемирной сети. Основные корневые серверы обозначаются тринадцатью именами, начинающимися с латинских буквенных индексов от A до M. Физически же таких серверов около 200, при этом по нескольку из них объединены общим именем. Эти серверы содержат информацию о цифровых IP-адресах доменов верхнего уровня типа .ru или .рф и их привязке к именам сайтов вида www.imya.ru или, например, город.рф. Другими словами, чтобы найти в сети тот или иной сайт в какой-либо стране, на корневых серверах должны быть прописаны таблицы маршрутизации обращений в присвоенном этой стране пуле цифровых IP-адресов. Систему корневых серверов контролирует Корпорация сетевых адресов и доменных имен (ICANN) по соглашению с правительством США, делегировавшим ей эту функцию.

Теоретически можно себе представить ситуацию, когда кто-то решит, что одну из стран нужно отключить от всемирной сети. И сделать это технически вроде бы можно: нужно просто убрать данные о национальном домене этой страны (например, .ru) из таблиц маршрутизации корневого сервера. Тогда никто в мире не будет «видеть» этот национальный сегмент сети. Как такового выхода в интернет наша страна при этом не лишится, но для пользователей рунета попадание на иностранные ресурсы будет существенно затруднено, т.к. придется в адресной строке набирать не привычный адрес, скажем, name.com, а его сетевой IP-адрес.

Директор Координационного центра национального домена сети Интернет (КЦ), который по договору с ICANN осуществляет поддержку российского пространства интернет-адресов и доменных имен, Андрей Колесников, пояснил, что в России создана достаточно устойчивая структура Рунета за 20 лет его жизни, базирующаяся на системе DNS-серверов технического центра КЦ и «зеркал» (то есть копий) нескольких корневых DNS-серверов. Можно достаточно быстро создать полное «зеркало» корневых серверов, содержащих адресную информацию о российском сегменте сети. Если это будет сделано, то исключение данных о Рунете из таблиц маршрутизации корневых серверов за рубежом в России никто из пользователей сети вообще не заметит. Для этого нужна лишь отлаженная координация действий между российскими операторами связи и структурой, которая вовремя обнаружит нарушение работы зарубежных корневых серверов и сообщит о нем операторам.

Эксперт отметил, что сетевое пространство России так просто не вычеркнешь и для зарубежных пользователей. Прежде всего, если убрать российскую адресацию из таблиц маршрутизации на серверах ICANN, эти записи будут какое-то время храниться в кэше — памяти локальных DNS-серверов в разных странах. То есть, мгновенного прекращения доступа к российскому интернет-пространству не произойдет. А когда зарубежные провайдеры доступа в интернет и государственные органы стран, не причастных к сетевой изоляции России, заметят деградацию сведений о российском адресном пространстве на серверах ICANN, они примут вполне понятные меры по ее преодолению. Для этого они смогут либо задействовать собственные «зеркала» корневых серверов, либо перенастроить маршруты доступа на «зеркало», расположенное в России. Так или иначе, доступ в российское интернет-пространство сохранится или будет восстановлен достаточно быстро. Также необходимо учитывать тот факт, что уже 4 года как один из тринадцати мировых DNS серверов находится в Новосибирске и если его «отрубить», ICANN придется перенастраивать всю систему глобальной сетевой  маршрутизации.

Один из ведущих экспертов в области информационных технологий, директор IT-компании «Барсум» Денис Милющенко в интервью «Эксперт Online» отметил, что даже если каким-то образом удастся отключить рунет от доступа к глобальной сети, массовый пользователь этого практически не почувствует. «Большинство жителей России пользуется локальными ресурсами – социальные сети (за исключением Facebook, которая, впрочем, до сих пор не стала массовой и сейчас лишь 10-я часть от VK), почтовые сервисы, СМИ и т.д. Пострадает лишь бизнес, завязанный на западный рынок, который составляет небольшую часть экономики, не более 10%, если не считать нефтегазовый сектор. В разрезе отраслей, прежде всего, тяжело будет экспортоориентированным софтверным компаниям – для них это будет катастрофа. Проблемы возникнут и у офшорных разработчиков. У них будет жесткий выбор - либо съезжать отсюда, либо бизнес сворачивать. Но большинство российских IT-компаний все же зарабатывают деньги внутри страны. В целом, такой шаг, как отключение России от глобальной сети, навредит в большей степени не нам, а самому Западу, поскольку интернет они используют как инструмент пропаганды и влияния на население страны, как  инструмент политики. В-общем, скорее всего, кто-то из политиков просто решил пропиариться - ляпнул, не подумав. А потом уже специалисты и более умные коллеги ему быстренько объяснили, какую ахинею он сморозил» - пояснил специалист.

Санкции Запада не критичны для российского освоения Арктики

9 окт 2014 - 03:57

Санкции на поставку оборудования и технологий для глубоководного бурения, введенные западными странами, не критичны для освоения российского шельфа Арктики. Об этом корр. ТАСС сообщил академик, член президиума РАН Николай Лаверов в кулуарах международной научной конференции "Конкурентный потенциал северных и арктических регионов" в Архангельске.

По его словам, глубоководные месторождения, например, в Мексиканском заливе, находятся на глубине от двух километров. "Мы же пока бурим на глубинах 100 метров и менее, - пояснил ученый. - Все Карское море, его шельфовая зона находится на глубинах, не превышающих 150-200 метров. Поэтому санкции абсолютно не критичны для нас, нам нужно сначала освоить малые глубины. Когда мы дойдем до больших глубин, то у нас и техника к тому времени будет своя, то есть будет последовательное развитие технологии".

Он отметил, что "глубокая вода - это перспектива и довольно дальняя". "Будем бурить и на глубокой воде, - уверен ученый. - Там очень много сложностей. На глубине два километра давление воды превышает 200 атмосфер. Представляете, какие жесткие требования это предъявляет к оборудованию, приборам. А цену ошибки мы знаем. На ликвидацию аварии в Мексиканском заливе было затрачено 20 млрд долларов".

"Пример же горизонтальных скважин (которые бурят вдоль пласта породы) показателен. Мы сначала бурили их на четыре километра, теперь уже на 10, то есть последовательно развиваемся, - сказал Лаверов. - У нас нет сейчас необходимости в глубоководном бурении. Разведанных запасов хватает, чтобы поступательно двигаться вперед. Я сторонник взвешенного подхода, и надеюсь, что мы не будем проявлять спешки в решении сложнейших проблем освоения Арктики".

Конференция в Архангельске собрала более 100 представителей научного, политического, экономического сообществ и общественности Канады, России, Франции, Японии, а также специалистов Европейского полярного совета (Страсбург) и Международного арктического научного комитета (Осло).

12 сентября США ввели новые санкции против России в связи с ситуацией на Украине. Под них попали, в частности, пять российских энергетических компаний - "Газпром", "Газпром Нефть", ЛУКОЙЛ, "Сургутнефтегаз" и "Роснефть". США не будут поставлять товары, услуги и технологии, необходимые для добычи нефти на глубоководных участках, арктическом шельфе или в сланцевых пластах.

Госкорпорация Ростех представила имортозамещающее медоборудование

9 окт 2014 - 03:55

"Объединенная приборостроительная корпорация" ("ОПК") госкорпорации Ростех представила инновационные разработки в области медицинского оборудования, которые в перспективе должны заменить дорогостоящие импортные образцы, сообщили РИА Новости в пресс-службе "ОПК".

"Объединенная приборостроительная корпорация" Госкорпорация Ростех, представила сразу две инновационные разработки в области медицинского оборудования — устройство стерильного соединения магистралей для переливания крови Vega-magistral и технологическую линию производства расходных материалов для него — специальных одноразовых пластин для сварки термопластичных трубок", — говорится в сообщении корпорации.

По данным "ОПК", работа над проектом шла чуть более двух лет. Совокупный объем финансирования составил около 200 миллионов рублей, в том числе свыше 80 миллионов было привлечено из внебюджетных источников.

В среду в ходе совещания о перспективах развития медицинских разработок "ОПК" технологическую линию осмотрел заместитель министра промышленности и торговли Российской Федерации Сергей Цыб. По данным корпорации, Цыб высоко оценил разработку и рекомендовал "ОПК" обратить внимание не только на внутренний, но и на внешний рынок. По его мнению, концерн "Вега" может стать достойным конкурентом японским производителям аналогичного оборудования, занимающим монопольное положение на мировом рынке в настоящий момент.

По данным корпорации, разработки, не имеющие аналогов в России, будут производиться на производственных мощностях концерна "Вега", входящего в "ОПК". "Они обладают самыми современными характеристиками и в перспективе должны заменить дорогостоящие импортные образцы, которые сейчас используются в отечественной медицине", — подчеркнули в пресс-службе.

По словам генерального директора ОАО "Объединенная приборостроительная корпорация" Александра Якунина проект осуществлялся по заказу государства. "Аппарат Vega-Magistral и соответствующие технологии создавались в ходе научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ. Новое производство строилось на базе нашего НИИ "Кулон" в рамках федеральной целевой программы "Развитие фармацевтической и медицинской промышленности Российской Федерации". Заказчиком всего комплекса работ выступил Минпромторг России", — приводят в пресс-службе слова Якунина. "Это один из первых реальных отечественных проектов в сфере производства современной медицинской техники, доведенный до логического завершения — до серийного производства", — подчеркнул он.

По данным корпорации, в ходе реализации проекта на площадке московского НИИ "Кулон" создано универсальное производство одноразовых сваривающих пластин мощностью до 10 миллионов штук в год. Установленное оборудование позволяет производить пластины не только для устройства Vega-Magistral, но и для импортных аналогов.

Новые разработки обеспечивают стерильное соединение магистралей полимерных контейнеров, которые используются в неотложной хирургии и трансфузионной терапии, а также для сбора и заготовки донорской крови.

По словам генерального директора ОАО "Концерн радиостроения "Вега" Владимира Вербы, стоимость сваривающих пластин российского производства примерно в три раза ниже стоимости пластин иностранных производителей, которые сейчас поставляются на российский рынок.

"Ориентировочный объем рынка импортных сваривающих пластин в 2012-2013 гг составил 3-4 миллиона штук на сумму 450-600 миллионов рублей. Их замена пластинами отечественного производства позволит существенно сэкономить", — подчеркнули в "ОПК".

Семейные традиции "Нобелевки"

6 октября 2014 года Нобелевскую премию по физиологии получили норвежские нейробиологи, муж и жена 52-летний Эдвард (Edvard I. Moser) и 51-летняя Мэй-Бритт Мозер (May-Britt Moser) за работы, в которых описываются механизмы головного мозга, ответственные за ориентацию в пространстве. Им досталась половина денежного эквивалента премии. Вторую половину получит Джон О`Киф (John O'Keefe). 

За всю историю премии это всего лишь пятая семейная пара, удостоенная одной из высших научных наград. Первыми была семья Пьера и Мари Кюри, получившая Нобелевку по физике в 1903 году. Впоследствии, уже после смерти мужа, Мари получила вторую Нобелевскую премию, по химии, в 1911 году. 

Одна из их дочерей, Ирен Жолио-Кюри (Irène Joliot-Curie), была удостоена Нобелевки по химии в 1935 году вместе со своим мужем Фредериком Жолио (Frédéric Joliot). Их младшая дочь Ева (Ève Curie) работала в ЮНИСЕФ, и была замужем за Генри Лабуиссом, который принял Нобелевскую премию мира от имени ЮНИСЕФ в 1965 году. 

В 1947 году семья выходцев из Австро-Венгрии, американских биохимиков Герти Терезы Корти и Карла Кори (Gerty Cori and Carl Cori) получила Нобелевку по физиологии «за открытие каталитического превращения гликогена». 

Раздельно премии получила семейная пара Мюрдалов: Гюннар Мюрдал (Gunnar Myrdal) был удостоен премии по экономике 1974 года за пионерские работы в области теории денег и экономических флуктуаций, а его жена, писатель и дипломат Элва (Alva Myrdal) - премии мира 1982 года за ее роль в переговорах ООН в деле разоружения и создания зон, свободных от ядерного оружия. 

На сайте Нобелевской премии приводятся факты, когда премию получали братья, а также отец и сын. Так, нидерландский экономист Ян Тинбергерн и его младший брат, эколог, орнитолог Николаас Тинбергерн (Jan and Nikolaas Tinbergen) были удостоены высокой награды по экономике (1969) и физиологии и медицине (1973) соответственно. 63-летний Ян получил премию «за создание и применение динамических моделей к анализу экономических процессов». А 66-летний Николаас получил Нобелевку совместно с Карлом фон Фришем и Конрадом Лоренцем «за открытия, связанные с созданием и установлением моделей индивидуального и группового поведения животных». Ян прожил 91 год, а его брат – 81. 

Много примеров такой позитивной семейственности у Нобелевской премии по физике. Отец и сын Уильям и Лоуренс Брэгги (William Bragg and Lawrence Bragg) получили Нобелевку в 1915 году за «их заслуги в анализе кристаллической решетки посредством рентгена». 

Шведский физик Манне Сигбан (Karl Manne Georg Siegbahn) получил Нобелевку в возрасте 38 лет в 1924 году «за открытия и исследования в области рентгеновской спектроскопии», а его сын Кай Сигбан (Kai M. Siegbahn), продолживший исследования в этой области, – в возрасте 63 лет в 1981 году «за вклад в развитие электронной спектроскопии высокого разрешения». 

Британский физик Джозеф Джон Томпсон в возрасте 50 лет был удостоен премии за открытие электрона, с формулировкой «за исследования прохождения электричества через газы» в 1906 году, а продолживший семейную традицию его 45-летний сын, Джордж Паджет Томпсон (George Paget Thomson), в 1937 году «за экспериментальное открытие дифракции электронов на кристаллах». 

Выдающийся датский физик Нильс Бор в возрасте 37 лет получил премию в 1922 году «за заслуги в изучении строения атома», а его сын Оге Бор (Aage N. Bohr) – в 53 года в 1975  году «за открытие взаимосвязи между коллективным движением и движением отдельной частицы в атомном ядре и развитие теории строения атомного ядра, базирующейся на этой взаимосвязи». 

Стоит отметить и семью потомственных американских биохимиков. Артур Корнберг (Arthur Kornberg) получил Нобелевку по медицине 1959 года, а его сын, биохимик Роджер Корнберг (Roger D. Kornberg) – по химии 2006. Жена Артура и мама Роджера – тоже биохимик. В 2010 году Роджер Корнберг совместно с Жоресом Алферовым стали сопредседателями научно-технического совета инновационного центра «Сколково». Интересно, что свою стажировку Артур Корнберг проходил в 1947 году в школе медицины Вашингтонского университета в Сент-Луисе у лауреатов Нобелевки Герты и Карла Корнов. Как раз в том году его научные руководители получили высшую научную награду, и в этом же году у него родился сын Роджер. 

Отец и сын Ойлеров, потомки выдающегося математика Эйлера, были удостоены двух Нобелевок. Шведский биохимик, выходец из Германии, Ханс фон Ойлер-Челпин (Hans von Euler-Chelpin) получил премию по химии 1929 года за открытие ферментации сахара и ферментативных энзимов, а его сын, физиолог Ольф фон Ойлер (Ulf von Euler) – премию по физиологии 1970 года «за открытия, касающиеся гуморальных передатчиков в нервных окончаниях и механизмов их хранения, выделения и инактивации».

«Наш Центр – один из крупнейших в России»

За последнее время геномика как наука становится все более популярной, и, естественно, что в нашем Сибирском отделении есть исследовательские организации, специализирующиеся именно на данной научной области. Одним из таких учреждений является Центр коллективного пользования «Геномика» СО РАН, о деятельности которого нам рассказал руководитель ЦКП Марсель Расимович Кабилов.

– Марсель Расимович, расскажите, пожалуйста, о деятельности Центра коллективного пользования «Геномика» СО РАН?

Наш центр – один из крупнейших в России как по приборному оснащению, так и по количеству пользователей. ЦКП предоставляет возможность институтам биологического профиля Сибирского отделения РАН, а также другим организациям по всей России реализовывать проекты, связанные с секвенированием геномов и генов всевозможных биологических объектов, таких как вирусы, бактерии, различные эукариоты от рыб до человека. География наших пользователей с запада на восток охватывает такие города, как Санкт-Петербург, Москва, Казань, Новосибирск, Томск, Красноярск, Иркутск, Улан-Уде, Чита, Якутск, Хабаровск и Владивосток. В общей сложности более трех десятков научных и коммерческих учреждений пользуются услугами центра.

При создании ЦКП его первым прибором стал однокапиллярный секвенатор фирмы Applied Biosystems. Сейчас трудно поверить, но тогда появление этого прибора было значительным прогрессом. Процесс секвенирования стал намного проще: не нужно было заливать гелем метровые стекла, проводить целый день электрофорез и вручную разбираться с сиквенсами. Тогда началась эпоха автоматизированного секвенирования по Сэнгеру (метод обрыва цепи). Длина такого прочтения составляет приблизительно 700-900 букв. Некоторое время дальнейшее развитие было экстенсивное, в приборах просто увеличивалось количество капилляров. В итоге самой производительной системой стал «96-капиллярник», который, кстати, активно использовался в проекте «Геном человека».

На этот эпохальный проект работали целые «заводы» по секвенированию: сотни приборов одновременно читали различные участки генома человека. Общая стоимость установления структуры человеческого генома составила 3 миллиарда долларов.

Сейчас с появлением платформ высокопроизводительного секвенирования проанализировать геном человека можно за несколько тысяч долларов. Однако следует отметить, что это возможно только потому, что был собран референс, т. е. стандарт, который мы можем использовать для сравнения. Тем не менее метод Сэнгера никуда не исчез, задачи, для решения которых необходимо прочитать в пределах нескольких сотен нуклеотидов, все также актуальны. Так, например, в 2013 г. наш центр проанализировал около 30 тысяч таких образцов.

Руководитель ЦКП «Геномика» Марсель Расимович Кабилов В настоящее время помимо стандартных капиллярных анализаторов для секвенирования по Сэнгеру ЦКП «Геномика» имеет в своем распоряжении и арсенал приборов для высокопроизводительного секвенирования, которые позволяют анализировать уже целые геномы. Думаю, многим по школьному курсу знакома центральная догма молекулярной биологии, которая формулирует перенос информации от ДНК в РНК и далее в белок. Так вот, геномные секвенаторы позволяют проводить анализ не только генома (ДНК), но и транскриптома (РНК) и опосредованно даже протеома (транслируемая РНК). Высокопроизводительное секвенирование – это мощный инструмент геномики, основной проблемой которого сейчас является биоинформатический анализ огромного массива получаемых данных.

– Как происходит взаимодействие пользователей с ЦКП?

У нас функционирует электронная система учета заказов наших пользователей. Человек удаленно через сайт регистрирует заказ в системе учета и вместе с заведенным бланком высылает нам образцы. После получения пробирок с образцами сотрудники ЦКП фиксируют это в системе учета, проводят секвенирование и выкладывают результаты в системе, которые пользователь может скачать.

Работы, связанные с высокопроизводительным секвенированием, как правило, требуют бóльшего участия ЦКП, которое выражается как в консультациях при планировании экспериментов, так и в непосредственном выполнении подготовки ДНК-библиотек.

– Занимается ли Центр реализацией собственных проектов?

ЦКП «Геномика» проводит собственные исследования, однако мы, как правило, всегда сотрудничаем с другими организациями – квалифицированными «объектодержателями», если можно так выразиться. Не считая нагрузки по предоставлению услуг секвенирования, в данный момент центр выполняет работы по более чем 20 совместным проектам. Учитывая, что исследования ведутся коллективом всего из 7 сотрудников, можно представить общую загруженность.

Среди направлений, которыми занимается Центр, можно отметить метагеномику, которая позволяет изучать не отдельный геном, а совокупность всех геномов сообщества микроорганизмов.

Одним из наших объектов является метагеном кишечника человека, по которому мы ведем несколько проектов, связанных с заболеваниями, а также с национальными особенностями людей. Еще один интересный объект – это вирус ядерного полиэдроза – биологическое оружие против опасного вредителя: непарного шелкопряда.

Исследование проводится совместно с лабораторией патогенеза насекомых института систематики и экологии животных СО РАН, для которой это давно исследуемый объект.

– Ведется ли Центром научно-образовательная деятельность?

Да, ЦКП периодически организует тематические школы и семинары. В июне 2015 г. мы планируем провести очередную конференцию «Высокопроизводительное секвенирование в геномике», куда и приглашаем всех коллег, интересующихся и занимающихся данной научной областью.

 

Маргарита Артёменко

Петербургский Политех будет делать программное обеспечение для лунных роботов

9 окт 2014 - 03:36

Ученые и студенты Петербургского политехнического университета (СПбПУ) разработают для российской космической отрасли математические модели систем охлаждения для будущего ядерного транспортного энергетического модуля, а также программное обеспечение для управления автоматами, которые будут работать на Луне и других планетах.

Соответствующие документы подписали в четверг на круглом столе в СПбПУ в присутствии руководителя Роскосмоса Олега Остапенко ректор университета Андрей Рудской и гендиректор головной научной организацией Роскосмоса - ФГУП ЦНИИмаш Александр Мильковский.

Выступая на круглом столе, руководитель Роскосмоса отметил, что на предприятия космической отрасли приходят около 4 тысяч выпускников вузов и средних учебных заведений в год, в то время как отрасль нуждается в ежегодном пополнении в 10 тысяч человек. Роскосмос для привлечения наиболее одаренных выпускников на работу в космические предприятия заключил соглашения о сотрудничестве с ведущими вузами страны, в числе которых - МГУ, СПбПУ, МГТУ им. Баумана, Амурский, Таврический, Казанский университеты.

В апреле 2014 года ЦНИИмаш и Петербургский политехнический университет подписали соглашение о сотрудничестве и план совместных работ на период до 2015 года. Специалисты ЦНИИмаша проанализировали разработки петербургских ученых и отобрали из них проекты, которые будут полезны для российской космической отрасли.

В их числе – проект «Двухфазность», в рамках которого будет создано программное обеспечение для трехмерного численного моделирования тепломассообмена в тепловых трубах. Эти модели позволят усовершенствовать системы охлаждения и обогрева на будущих пилотируемых и автоматических космических аппаратах. Особенно эта разработка актуальна для будущего российского транспортно-энергетического модуля (ТЭМ) с ядерной энергетической установкой, который нуждается в эффективной системе отвода тепла.

Другой проект петербургских ученых – «Обмен» – предусматривает созданию технологий обмена информацией и управления роботами на поверхности Луны и других планет. В его рамках будут созданы протоколы обмена данными и управления, алгоритмы взаимодействия автоматов между собой, методы применения технологий облачных вычислений, будет проведена экспериментальная отработка этих алгоритмов и протоколов.

Два этих проекта будут включены в «большой» проект ЦНИИмаша «Магистраль». В рамках круглого стола ректор СПбПУ Андрей Рудской и директор ЦНИИмаша Александр Мильковский подписали согласованные технические задания на эти проекты. Помимо этих двух проектов, специалисты ЦНИИмаша одобрили еще семь проектов, вопрос об их запуске обсуждается.

Научное сотрудничество вузов стран ШОС обсудят на Алтае

8 окт 2014 - 04:56

Научное сотрудничество и совместные образовательные программы головных вузов государств-членов Шанхайской организации сотрудничества (ШОС) обсудят в рамках VIII недели образования в столице Алтайского края — Барнауле, сообщает пресс-служба краевой администрации.

В пресс-службе отмечают, что на открытии недели образования будут присутствовать руководители более 50 ведущих вузов стран ШОС. В ближайшие два дня им предстоит обсудить приоритетные направления и формы деятельности головных вузов ШОС, их научное сотрудничество и совместные образовательные программы. В частности, пройдут семь заседаний круглых столов: "Регионоведение", "Энергетика", "Нанотехнологии", "IT-технологии", "Экономика", "Педагогика" и "Экология".

"В концертном зале Алтайского госуниверситета состоится торжественное открытие… Участие в нем примут представитель генерального секретаря ШОС, а также заместитель руководителя Россотрудничества Лариса Ефремова и замминистра образования и науки РФ Вениамин Каганов", — говорится в сообщении.

Модератором пленарного заседания станет председатель Совета ректоров Университета ШОС, ректор Российского университета дружбы народов Владимир Филиппов. Вместе с Ларисой Ефремовой они представят доклад о роли и месте Университета ШОС в деятельности Шанхайской организации сотрудничества.

Также запланировано открытие центров изучения русского языка в Кыргызстане и Таджикистане, почетной кафедры "Казахстанский путь — Нурсултан Назарбаев", Российско-Китайского центра, Научно-образовательного кластера биомедицины и биотехнологий и выставки "Новые археологические открытия на Алтае".

В рамках недели образования также состоится расширенное заседание Совета ректоров головных (базовых) вузов Университета ШОС. Мероприятия пройдут при поддержке министерства образования и науки РФ, Россотрудничества, Координационного совета Университета Шанхайской организации сотрудничества.

Открылся Кузбасский международный угольный форум

8 окт 2014 - 04:55

Единственный в России деловой форум и выставочное мероприятие с «угледобывающей концепцией», объединяющее горняков, машиностроителей, энергетиков и представителей научного сообщества сегодня дало старт в областной столице.

В этом году давно ставший (16 лет) ежегодным форум пройдёт в Кемерове с 8 по 10 октября. Принять участие в мероприятии изъявили желание более 150 компаний, организаций и учреждений из десяти стран как «ближнего» (Казахстан, Беларусь, Киргизия, Таджикистан, Украина), так и «дальнего» (Чехия, Китай, Швейцария, Германия) зарубежья.

Основным событием первого дня работы форума станет совместное пленарное заседание двух научных конференций: Международного российско-казахского симпозиума «Углехимия и экология Кузбасса» и XVI научно-практической конференции «Энергетическая безопасность России: новые подходы к развитию угольной промышленности». Всё происходящее на пленуме смогут увидеть студенты и преподаватели «профильных» технических вузов с помощью организованной видеотрансляции.

Среди заявленных мероприятий форума – пресс-конференция «Актуальные вопросы угольной промышленности Кузбасса и России» с участием заместителя директора департамента угольной и торфяной промышленности Министерства энергетики Сергея Шумкова, учёных: директора Института углехимии и химического материаловедения СО РАН Зинфера Исмагилова, директора Института угля СО РАН Владимира Клишина и ректора КузГТУ Владимира Ковалёва, а также заместителя губернатора Кемеровской области Андрея Гаммершмидта.

В Москве стартовал Фестиваль актуального научного кино 360°

8 окт 2014 - 04:52

С 8 по 15 октября пройдет IV Международный фестиваль актуального научного кино 360°, говорится в пресс-релизе, поступившем в «Газету.Ru».

В международную конкурсную программу фестиваля, который организован Политехническим музеем совместно с фондом «Сколково» и Открытым университетом Сколково при поддержке правительства Москвы, в 2014 году отобраны 13 фильмов.

Внеконкурсная программа фестиваля 360° состоит из нескольких тематических разделов: «Жизнь замечательных людей» (совместно с Российской венчурной компанией), «360˚.Земля» (совместно с Русским географическим обществом), 360˚.Education (совместно с Открытым университетом Сколково), «Программа интерактивной документалистики In.Doc.House» и ретроспектива картин Феликса Соболева.

Впервые в этом году фестиваль представит программу научно-популярных фильмов, снятых в России.

Страницы

Подписка на АКАДЕМГОРОДОК RSS