Большая конференция по "большим данным"

Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирский государственный университет и Научный совет по биоинформатике СО РАН выступили организаторами 14-й Международной конференции «Биоинформатике регуляции и структуры геномов / системная биология» (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure / Systems Biology, BGRS\SB-2024), которая проходила с 5 по 10 августа 2024 года.

БГРС –  это самая длинная в мире по своей непрерывной истории крупная международная конференция в области биоинформатики и системной компьютерной биологии (26 лет, начиная с 1998 года), в которой приняли участие многие тысячи ученых из десятков стран мира. Программа мультиконференции была разделена на тринадцать симпозиумов (каждый, в свою очередь содержал от двух до шести тематических секций), в рамках которых было заслушано 793 доклада, из которых 470 были устными и 323 стендовых. А всего в работе мультиконференции приняло участие более 1000 человек (в т.ч. очно — 680) из 32 стран.Для сравнения, в прошлой BGRS\SB-2022 участвовало около 900 учёных из 34 стран. Эта динамика говорит о том, что проблемы биоинформатики и роли «больших генетических данных» в развитии наук о жизни пользуются огромным интересом в научном сообществе. А еще и о той роли, которую конференция сегодня играет в качестве площадки для обсуждения проблем и достижений в этой области. Причем – достаточно давно, история конференции превышает четверть века, что делает ее так же одним из старейших научных форумов в постсоветском периоде истории нашей страны.

Открывая конференцию, председатель Президиума BGRS/SB-2024, научный руководитель ИЦиГ СО РАН, академик РАН Николай Колчанов отметил:

«Стремительное развитие омиксных технологий (геномики, транскриптомики, протеомики, метаболомики) и других высокопроизводительных методов экспериментального исследования молекулярно-генетических систем и процессов привело к информационному взрыву в генетике, и она стала главным источником больших данных, перегнав по темпам роста и объёмам накапливаемой информации не только все другие науки и технологии, но и мировые социальные сети. В связи с этим сегодня перед биоинформатикой и системной компьютерной биологией стоят очень серьезные задачи. Прежде всего, это анализ больших генетических данных  и на этой основе — реконструкция, анализ и моделирование структурной организации и  молекулярно-генетических механизмов функционирования геномов и   кодируемых ими генетических макромолекул (ДНК, РНК и белков), а также генных сетей — ансамблей координированно функционирующих генов), обеспечивающих формирование всех без исключения фенотипических признаков и характеристик клеток, тканей, органов, целостных организмов, а  также воспроизведение популяций и даже функционирование экосистем».

Характерной особенностью конференции является то, что она вызывает огромный интерес не только у биологов, генетиков и медиков, но также и у   математиков и специалистов, работающих в области информационных технологий.

«Если мы говорим о задачах, которые стоят перед математиками в плане работы с биологами, то это, безусловно, обработка и анализ больших генетических данных и на этой основе – реконструкция, компьютерный анализ и моделирование молекулярно-генетических систем и процессов на различных иерархических уровнях организации живых систем.  Эти подходы в ряде случаев способны заменить дорогостоящие и очень сложные по своей реализации эксперименты и позволяют вполне адекватно предсказывать поведение живых систем в ответ на воздействие различных внутренних и внешних факторов. История нашей науки показывает, что это очень сложная, но, тем не менее, решаемая задача», — подчеркнул директор Института вычислительной математики и математической геофизики, профессор РАН Михаил Марченко.

Активное участие в работе конференции принимает не только научное сообщество, но и высокотехнологичный бизнес. Спонсорами конференции в этом году выступили ООО «Диаэм», ООО «БИОЛАБМИКС», ООО «СкайДжин», ООО «НПФ СИНТОЛ», ООО «МПБА Диагностика», ООО «Компания Хеликон», NextGenSeq.tech (ООО «Альгавитапро»), ООО «БелБиоЛаб», ООО «ТД «Химмед», ООО «Лакопа», ООО «Сесана», ООО «Биохимический базар».

Что интересно сами компании оценивают участие в подобных мероприятиях как довольно перспективное. «Конференция BGRS\SB — это лидер сбора научных аккаунтов для освещения актуальных тем по молекулярной биологии, геномике, секвенированию, где мы являемся экспертами. Это мероприятие является ключевым для нас и научных специалистов. То, что мы видим — это те люди, которым мы нужны, и которые нужны нам», – поделился своими впечатлениями руководитель отдела продаж ООО «СкайДжин» Александр Петров.

Подводя же научные итоги прошедшей конференции, академик Колчанов подчеркнул: «Новая эра больших генетических данных, в которую входят науки о жизни, требует трансформации базовых подходов   биоинформатики и системной компьютерной биологии. В чём это проявляется? Во-первых, в широчайшем применении методов искусственного интеллекта и их интеграции с классическими методами биоинформатики и системной компьютерной биологии.  Во-вторых, в разработке на этой основе нового   поколения информационно-программных систем для планирования экспериментов по проверке результатов компьютерных предсказаний, полученных на основе анализа больших генетических данных. Движение в этом направлении будет означать, фактически, смену базовой парадигмы исследований: от науки, направляемой гипотезами, к науке, направляемой   большими данными. И биоинформатика, как показывает проведённая нами конференция, находится   на острие этого движения к   новой биологии

Напомним, конференция проводится раз в два года, и следующая пройдет в 2026 году. Скорее всего местом ее проведения, как обещал на церемонии открытия ректор НГУ, академик РАН Михаил Федорук, станет уже площадка нового университетского кампуса, а значит у BGRS\SB появится пространство для дальнейшего развития.

Пресс-служба Института цитологии и генетики СО РАН